An improved primer set and amplification protocol with increased specificity and sensitivity targeting the Symbiodinium ITS2 region for next-generation sequencing diversity assessment.
Pour étudier la diversité des holobiontes des récifs coralliens et plus particulièrement le Symbiodinium, les symbiotes algaux de l’hôte animal, il faut trouver un protocole spécifique et sensible. Cet article présente un protocole d’amplification standardisé utilisant un ensemble d’amorces très sensibles. Ce protocole, utilisé pendant Tara Pacific, permettra de maximiser le retour d’informations à partir d’un large éventail de types d’échantillons tout en maintenant la comparabilité avec les projets futurs et existants.